食品工业科技

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国内刊号:11-1759/TS

国际刊号:1002-0306

食品工业科技杂志2020年第20期:利用Illumina高通量测序技术筛选低温降解玉米秸秆真菌

发布日期:

作者:徐丽萍, 姜喆, 葛英亮, 王鑫, 倪燕

关键词:高通量测序,真菌菌群,筛选,降解,鉴定,

玉米秸秆及根际土壤中纤维素降解菌资源丰富,本研究旨在分析其真菌群落结构及低温纤维素降解真菌的筛选。采集玉米秸秆及根际土壤,利用高通量测序方法对其中的真菌群落结构进行生物信息学分析,以羧甲基纤维素钠为唯一碳源,筛选低温纤维素降解真菌并通过ITS测序进行菌种鉴定。结果表明,对玉米秸秆及秸秆根部土壤测序共获得20715913 bp,共拼接成82250个基因片段,平均长度为249.29 bp,其中共发现5个真菌门,确定共有的优势菌属为Guehomyce;通过在15 ℃低温筛选、比较0、5、10、15 ℃低温下经刚果红染色产生的透明圈与菌落直径的比值得到3株产酶能力较强的纤维素降解真菌,分别为FB1、FB7、FB8。结合液态发酵测定其降解率分别是27.66%、21.53%、23.01%,最终确定菌株FB1分泌纤维素酶效果最好、降解效果最佳,经鉴定后确认为假枝孢菌(Cladosporium pseudocladosporioides)。

来源:2020年第20期

《食品工业科技》期刊编辑部

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