食品工业科技

作者：丁淑金, 杨彦萍, 邓茹友, 马福仙, 尹拓, 张汉尧

关键词：葡萄汁酵母,<i>NOT5</i>基因,生物信息学分析,转录组,在线分析工具,

目的：从转录组分析数据中得到葡萄汁酵母NOT5基因，并对其进行生物学信息分析，为后期研究该基因的作用打下基础。方法：使用在线分析工具COILS Server、SOPMA、Alpha Fold 等分析预测NOT5基因编码蛋白质的一级结构、二级结构、三级结构及其结构域。结果：葡萄汁酵母NOT5基因核苷酸序列的开放阅读框为1446 bp，可编码481个氨基酸，位于XVI染色体690107~691789，在系统发育树中与真贝酵母（Saccharomyces eubayanus NOT5 like protein XP018219088.1）NOT5基因的亲缘关系最近；其编码的蛋白质是不稳定的亲水蛋白，分子式为C2493H3848N654O795S19，分子质量为56311.02，不含信号肽，无跨膜区域，存在卷曲螺旋区域，亚细胞定位于细胞质中的线粒体上；蛋白质的二级结构以随机卷曲为主；预测存在Pfam Not3和Pfam NOT2_3_5结构域；以Yeast Not1-Not2-Not5 (4by6.1.C)为模板构建NOT5蛋白的三级结构，两者的序列一致性可以达到89.88%。结论：葡萄汁酵母NOT5基因编码的蛋白结构不稳定，可能在细胞中互连翻译和转录。

来源：2022年第18期

《食品工业科技》期刊编辑部

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